產(chǎn)品名稱：標(biāo)準(zhǔn)參考物質(zhì) NIST RM 8398(QTY10) - 人類DNA全基因組變異評估(猶他州/歐洲血統(tǒng)的女兒)(HG-001)
英文名稱：Human DNA for Whole-Genome Variant Assessment (Daughter of Utah/European Ancestry) (HG-001)
品牌：美國NIST標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)
運(yùn)輸信息：干冰
| 產(chǎn)品編號 | 規(guī)格 | 貨期 | 銷售價(jià) | 您的折扣價(jià) |
|---|---|---|---|---|
| RM 8398(QTY10) | 10 vials of RM 8398 | 6周 | 37410 | 立即咨詢 |
- COA
- MSDS
NIST RM 8398 人類DNA 全基因組變異評估 標(biāo)準(zhǔn)品旨在用于驗(yàn)證,、優(yōu)化和過程評估目的。它由猶他州/歐洲血統(tǒng)的女性全.人類基因組樣本組成,，可用于評估基因組測序中變異調(diào)用的性能,。
該材料旨在通過獲得真陽性、假陽性和假陰性的估計(jì)值來評估人類基因組測序變異檢出的性能,。測序應(yīng)用可能包括全基因組測序,、全外顯子組測序和更有針對性的測序，例如基因組,。這種基因組 DNA 的分析方式與實(shí)驗(yàn)室處理和分析提取的 DNA 的任何其他樣本相同,。由于 RM 是提取的 DNA，因此它對于評估 DNA 提取等分析前步驟沒有用處,，但它確實(shí)挑戰(zhàn)了測序文庫的制備,、測序機(jī)器以及作圖、比對和變異調(diào)用的生物信息學(xué)步驟,。此 RM 并非旨在評估后續(xù)的生物信息學(xué)步驟,，例如功能或臨床解釋。
規(guī)格：
NIST RM 8398 人類DNA 全基因組變異評估 標(biāo)準(zhǔn)品由一個(gè)裝有人類基因組 DNA 的小瓶組成,，該基因組 DNA 是從單個(gè)大生長的人類淋巴母細(xì)胞系 GM12878（標(biāo)記為 HG-001）中提取的,。
科里爾醫(yī)學(xué)研究所（新澤西州卡姆登）。該小瓶含有大約 10 μg 基因組 DNA,，DNA 位于 TE 緩沖液（10 mM TRIS，1 mM EDTA,，pH 8.0）中,。
信息值：
為單核苷酸變異 (SNV),、小插入和缺失 (indel) 以及純合參考基因型提供信息值。 v3.3.2 基準(zhǔn)測試集涵蓋了大約 91% 的 GRCh37 組件和 85% 的 GRCh38 組件（不包括組件中的間隙）,，使用方法參考 1 中描述的信息值,。信息值被認(rèn)為是 RM 用戶感興趣和使用的值，但沒有足夠的信息來評估與該值相關(guān)的不確定性,。我們使用當(dāng)前可用的數(shù)據(jù)和方法描述和傳播我們對基因型的最佳,、最自信的估計(jì)。隨著新數(shù)據(jù)的積累以及測量和信息學(xué)方法的出現(xiàn),，這些數(shù)據(jù)和基因組特征將隨著時(shí)間的推移而得到維護(hù),。 HG-001 的數(shù)據(jù)可在國家生物技術(shù)信息中心 (NCBI) 序列讀取檔案的 BioSample SAMN03492678 下找到。信息值以變體調(diào)用文件 (vcf) 的形式給出,，其中包含基準(zhǔn) SNV 和小插入缺失,，以及一個(gè)制表符分隔的“床"文件，該文件描述了基準(zhǔn)區(qū)域,，其中任何不在基準(zhǔn) vcf 中的其他變體都應(yīng)該是錯(cuò)誤,。信息值不能用于建立計(jì)量溯源性。
陳經(jīng)理（銷售）
